El centrocampista malagueño, llegó a Sevilla de la mano de Julen Lopetegui en agosto de 2022. Isco fue bien recibido en el club y se convirtió en la “figura” que aclamaba que llegara la afición. A pesar de todo Isco nunca pudo llegar a demostrar su máximo nivel en el club, mantuvo un rendimiento aceptable que al sevillismo se le quedaba corto en ciertos partidos. En diciembre de 2022, el malagueño decide abandonar el club, dejando incertidumbre en la gente, ya que no sabían, que había ocurrido para su marcha, en el mejor momento de nivel de Isco.
Isco en una entrevista con Marca, habló de su experiencia y situaciones en el Sevilla FC. El malagueño comunica que tras la marcha de Lopetegui, y la llegada de Sampaoli, se empezaban a ver cosas raras dentro del club. Asuntos los cuáles trasladó a Monchi para que le aclarara la situación.
Tras esto se formó lo “fuerte” de lo sucedido, según Isco, Monchi comenzó a correr la voz de que el malagueño quería irse del club, cuando no era cierto, además de presionar al malagueño y a su abogado para que firmasen la rescisión del contrato. Por lo que el centrocampista, se volvió a dirigir personalmente con el director deportivo para aclarar el tema: “Mira Monchi, tú no estas siendo sincero ni conmigo ni con la gente a la que cuentas cosas, yo me quiero quedar y tu vas diciendo que me quiero ir”.
Tras estas declaraciones, Isco le dijo a Monchi tras un entrenamiento que era la persona más mentirosa que había conocido en el mundo del fútbol, palabras la cuáles no fueron bien recibidas por Monchi, ya que Isco cuenta que le cogió del cuello, le agredió y tuvieron que ser separados. Situación la cuál el malagueño no iba a soportar, ya que desde el club nadie se le disculpó por lo sucedido, y decidió marcharse finalmente.